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ConTour: 医药探索中多关联数据的数据驱动探究系统

论文:ConTour: Data-Driven Exploration of Multi-Relational Datasets for Drug Discovery
作者:Christian Partl, Alexander Lex, Marc Streit, Hendrik Strobelt, Anne-Mai Wassermann, Hanspeter Pfister and Dieter Schmalstieg

发表会议:VAST 2014

在现有的医药、化学领域探究多种关联性信息的研究中,由于数据尺度、关联性复杂等问题,快速探究多关联性很有难度,本文设计了名为ConTour的针对探索复杂、多关联性数据的交互性可视分析技术。用于探究在药物探索中,对药物潜在有效性和安全性的研究工作。

系统在功能上是对个体项目进行一系列属性关系的重排序;利用列嵌套、筛选等交互在表现具有父子关系的关联信息的交互,通过关系视图表达列与列之间的关联性的强弱、数据丰富的属性;通过细节视图同时表达多个数据集之间的多个个体的关联关系。

本文的相关工作分为三个部分:

1.Graph Exploration:Jigsaw、GraphTail

2.Faceted Browsing:InfoZoom、FOCUS

3.Pharmacology visualization: 相关的医药研究领域的可视化工具

本文的系统设计基于医学上的Biological Fingerprints(基因指纹)的概念,用来记录能够作用在细胞或者有机体上的分子和反应过程。设计的目标需求由相关专业领域的专家们提出:1.系统可以表现药物的反应机制;2.系统可以表现药物机制的生物反应流程;3.系统能够观察到在特定的治疗方案中新药品的潜在效用。

系统的数据是医药公司提供的大规模尺度的Pathways数据,从中我们可以提炼出相关的Gene,Compunds,Fingerprints,Therapeutic Groups数据集,用于探究其中的关联信息。

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